Fox Mulder wierzy w zjawiska paranormalne, a Dana Scully szuka naukowych wyjaśnień. W Z Archiwum X ta różnica jest podstawą relacji obojga agentów, ale widzów od lat skłania też do pytania, kto adekwatnie jest główną postacią serialu. Jedni wskazują sceptyczną agentkę, inni jej partnera. Chris Carter mówiąc o miejscu bohaterki w jego pomyśle na opowieść tylko dorzucił się do sporu. Twórca wyjaśnił, jak rozumiał jej zadanie u boku Muldera i dlaczego tak bardzo zależało mu na połączeniu kobiecej postaci z nauką.
9 listopada 2026 roku ScreenRant przypomniał wypowiedź twórcy, odczytując ją jako wskazanie Scully na protagonistkę serialu. Słowa padły podczas spotkania z publicznością na festiwalu NIFFF w Szwajcarii w lipcu 2015 roku. Carter odpowiadał wówczas na pytanie w ramach sesji Q&A. Opowiadał o relacji między bohaterami, a znaczenie agentki wyjaśnił przez jej sceptyczne podejście do świata. W przytoczonej przez serwis odpowiedzi mówił również o wątpliwościach, które jego zdaniem dzielą z nią widzowie.
Dla mnie Scully jest centrum naszego serialu – jest sceptyczką, którą wszyscy w sobie nosimy.
Wybór naukowego wykształcenia bohaterki twórca opisał jako instynktowny. Przyznał, iż nie wie, co ta decyzja o nim mówi, ale od początku widział tę parę jako mężczyznę i kobietę, a silne postaci kobiece od zawsze go interesowały. Dalej tłumaczył, iż u podstaw science fiction leży nauka, a sceptyczna agentka równoważy paranormalne przekonania partnera. Sięgnął przy tym po porównanie do układu słonecznego: jej wpływ miał utrzymywać serialowy świat na miejscu, tak jak siła, która zapewnia równowagę całemu układowi.
Spór o bohaterów nie ustaje. W listopadzie 2026 roku do słów Cartera wrócili też użytkownicy Reddita. Autor wątku na r/XFiles przypomniał dawną wypowiedź twórcy i zapytał, kogo odbiorcy uznają za główną postać. Część komentujących odpowiedziała, iż widz poznaje świat serialu z perspektywy Scully, granej przez Gillian Anderson. Inni przypisali centralną rolę Mulderowi, w którego wciela się David Duchovny.
